Sci Adv:没有证据大力支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2021-11-02 00:58:23 来源:
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导言:在早期下一阶段,有机物就开始了在不改变生物体巨噬细胞DNA组织次序的前提留下来使其DNA发挥不同的功能,而这就是通过给DNA蛋白质上添加生物化学标示来实现的。DNA丝氨酸是两栖类的关键表型表现型的子系统,其中会5-苯基胞嘧啶(5mc)是最常见的DNA剪裁之一。6mdA是生物体受限特质剪裁子系统的基本构成成分,现有在两栖类中会依赖已确定的受限特质剪裁子系统。来得进一步有不少社会科学研究路透社,6mdA也存在于两栖类中会,但并无证据支持。

近日,在《社会科学十分困难》上的一项社会科学研究中会,挪威林雪平大学的社会科学研究其他部门假定,两栖类巨噬细胞中会存在生物体表型表现型标示很显然被污染源了,并且没足够的证据来假定两栖类中会存在这种剪裁。

N6-苯基腺嘌呤(6mdA)是生物体中会广泛的DNA剪裁,但近期在两栖类DNA中会也赢取了表征。然而,社会科学研究其他部门谈到,即使对来自大致相同两栖类巨噬细胞类型的DNA进行的6mdA谱图和总质量测定社会科学研究也不一致。

为了实质特质说明6mdA在两栖类表征国际准则中会的作用,社会科学研究其他部门运用了体外将有机体幼稚T辅助(NTH)巨噬细胞分裂为TH巨噬细胞亚群的能力也。但是,与来得进一步的社会科学研究相反,他们发掘出TH分化现实生活中会6mdA的总质量没全局变异,并且注意到到分化的T巨噬细胞中会的6mdA素质与未丝氨酸的全DNA缩减DNA大致相同,这假定6mdA并未以可扫描的素质存在有机体T巨噬细胞中会。

他们还分析了从六个有机体巨噬细胞系中会提炼的DNA中会的6mdA,并解剖出两个具有高于背景频谱素质的6mdA素质的巨噬细胞系。出乎意料的是,两种分开的293T巨噬细胞系培养物具有不同的6mdA素质,这假定社会科学研究其他部门注意到到的6mdA信号并非巨噬细胞类型本身固有的。确实,当他们实质特质看时,他们发掘出两条6mdA素质升高的巨噬细胞系被感染特质同属污染源,感染特质同属一种常见的生物体巨噬动物细胞物中会富含6mdA的污染源物。当他们用感染特质基因表达抗生素Plasmocin处理巨噬细胞系时,6mdA信号降低为A阴特质对照。

“我们意识到通过这些应用扫描到的6mdA'信号'只是频谱。但是,由于一些复杂的应用关键问题,几种分析方法中会的背景频谱不是随机的,而是真实信号。”高级作者Colm Nestor(科尔姆·内斯特)在一份声明中会感叹。

社会科学研究其他部门分析了以前通过DNA免疫沉淀测序、质谱和单生物化学键可实现测序在两栖类巨噬细胞中会取向或扫描6mdA的努力。人们发掘出每种分析方法都有局限特质或缺陷,使表型表现型标示的假阳特质发掘出部将极低,似乎假定林雪平社会科学研究其他部门并不认为不存在这种情形的证据。

这组作者谈到:“我们假定,RNA和生物体污染源、突变横向重排特质和其他应用受限的结合已导致6mdA在两栖类DNA中会的反复正确标记。随着DNA和RNA剪裁家族的不停下降,以及以前相符剪裁的凸显越来越罕见,即使适用多种二者之间分析方法,我们也阐释了正确发掘出的来得实质特质。我们要求适用剪裁和未剪裁的DNADNA准则作为今后对动植物DNA剪裁的社会科学研究的高于允许,以及在适用前来得全面地测试突变基因表达。”

内斯特多余感叹,社会科学研究其他部门在社会科学研究非常罕见的情形时必须非常小心,选项适用哪种分析方法,并考虑到他们是不是真正在取决于存在的事物。他感叹:“现在我们可以毫无疑问地感叹两栖类中会不存在6mdA。关于6mdA,如果社会科学研究其他部门暂时社会科学研究真正不存在的东西,则可以花费大量一段时间和借贷,并且消除了很多来得让人尴尬的不想。”

原始注解:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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